Les immunodéficiences primaires sont classées et publiées par intervalles de plusieurs années par un groupe de travail scientifique de l'Organisation mondiale de la santé (OMS). les progrès génétiques immunologiques et moléculaires permettent une classification des immunodéficiences dans le système des lymphocytes B et T (sélectivement ou en combinaison), des déficiences complémentaires ou des défauts immunitaires comme symptômes partiels d'autres maladies génétiques. En raison de la grande augmentation du risque d'infection, des changements génétiques du système hématopoïétique telles que la neutropénie congénitale sont également comptés parmi les DIP. L'OMS distingue les huit sous-groupes d'immunodéficiences primaires suivants :
Dans les immunodéficiences combinées, les lymphocytes B et T sont affectés. Comme forme sévère de la maladie, un déficit immunitaire combiné est présent (immunodéficience combinée sévère, SCID), avec une perte de valeur quantitative et/ou fonctionnelle des lymphocytes T et B. Les déficiences immunitaires combinées se manifestent généralement dès la petite enfance. Ici, les infections opportunistes visiblement fréquentes comme le cytomégalovirus ou Pneumocystis carinii (anciennement carinii) se font remarquer, en plus d'une lymphadénopathie, d'une diarrhée chronique, d'un retard de croissance et de changements inflammatoires de la peau et des muqueuses. Sans traitement, la plupart des nourrissons pourraient mourir dans leur première année de vie. La thérapie curative est une transplantation de cellules souches; dans les cas isolés, une thérapie génique somatique est possible. Des exemples d'immunodéficiences combinées sont le DICS (TB +), le DICS (TB), le syndrome d'Omenn, le syndrome d'hyper-IgM lié à l'X, une carence en CD40, une carence en CD8, une carence en ZAP-70 ou en TAP-1 et TAP-2.
Les immunodéficiences avec déficit prédominant en anticorps montrent soit une différenciation des cellules B perturbée, soit une stimulation des lymphocytes B déficiente ou dépendante des cellules T. En raison des anticorps IgG maternels (protection du nid) transmis par voie diaplacentale, ces anomalies ne se manifestent que dans la petite enfance. Certaines ne sont reconnues qu'à l'adolescence ou même à l'âge adulte. Les infections dues à des agents pathogènes pyogènes tels que les streptocoques et les staphylocoques sont frappantes. Des exemples d'immunodéficiences avec déficit prédominant en anticorps sont l'agammaglobulinémie liée à l'X (XLA), l'anomalie de la chaîne lourde de l'immunoglobuline, le déficit sélectif de certains isotypes d'immunoglobulines tels que le déficit en IgA ou sous-classe des IgG, l'anomalie de la chaîne k, le déficit en activation-induced cytidine deaminase (déficit en AID) ou l'hypogammaglobulinémie transitoire du nourrisson.
Outre les maladies déjà répertoriées, il existe des anomalies affectant principalement les lymphocytes T. La génétique et la pathogenèse de ce groupe de maladies n'ont pas été suffisamment explorées. Les symptômes sont les mêmes que ceux des immunodéficiences combinées. Des exemples d'immunodéficience dans lesquels une anomalie des lymphocytes T est au premier plan sont la lymphopénie CD4 idiopathique, la déficience en interleukine 2, la déficience en cytokines multiples ou des anomalies dans la transduction du signal lymphocytaire intracellulaire.
Il existe des déficiences immunitaires qui affectent d'autres systèmes organiques, tels que le cervelet pour le syndrome de Louis-Bar ou le cœur pour le syndrome de Di George. Une immunodéficience est au premier plan et est principalement responsable des symptômes. Selon le type de maladie, les caractéristiques les plus évidentes sont une thrombocytopénie, une anémie, des infections, des modifications auto-immunes, une ataxie, des lymphomes et une sensibilité accrue aux rayonnements ionisants. Des exemples du groupe "autres syndromes d'immunodéficience bien définis" sont le syndrome de Louis Bar, le syndrome de Di George, le syndrome de Wiskott-Aldrich, le syndrome de rupture de Nimègue, la lymphohistiocytose hémophagocytaire familiale (LHF) ou les syndromes lymphoprolifératifs liés à l'X tels que le syndrome de Purtilo et syndrome de Duncan.
Les immunodéficiences associées à une maladie lymphoproliférative reposent sur une induction perturbée de l'apoptose. Les symptômes cliniques sont principalement des ganglions lymphatiques enflés, une hépato- et/ou une splénomégalie, une anémie hémolytique, une thrombocytopénie auto-immune, une neutropénie et une hypergammaglobulinémie polyclonale. Le principal représentant de ce groupe est le syndrome lymphoprolifératif auto-immun (ALPS).
Ce groupe comprend des déficiences immunitaires survenant dans le contexte d'autres maladies systémiques. Selon le type de maladie, les symptômes d'immunodéficience ou de la maladie sous-jacente prédominent. L'anémie de Fanconi, le syndrome de Dubowitz, l'acidémie méthylmalonique ou la dyskératose congénitale sont des exemples de maladies associées à des immunodéficiences.
Il existe une variété de déficiences possibles dans le système du complément. Dans ce cas, les facteurs de complément C1 à C9 peuvent être mal compris, mais également les facteurs de régulation tels que l'inhibiteur de C1-estérase ou la protéine de liaison à C4. Les défauts dans C1, C2 et C4 se manifestent principalement sous forme de lupus érythémateux disséminé. Les défauts de la cascade du complément terminal C5 à 9 sont plus susceptibles d'être dus à une sensibilité accrue à la bactérie Neisseria meningitidis. Le représentant le plus fréquent de ce groupe est le défaut ou la carence en inhibiteur de la C1 estérase entraînant un angio-œdème héréditaire.
Les déficiences des granulocytes et des macrophages peuvent être dues à la différenciation, à la motilité et à la formation intracellulaire de radicaux d'oxygène. Elles se manifestent souvent sous la forme d'infections bactériennes et/ou d'infections fongiques. Des exemples de ce groupe sont le syndrome de Kostmann, le syndrome de Shwachman-Bodian-Diamond, la neutropénie cyclique ou liée à l'X et les défauts d'adhérence des leucocytes de type 1 et 2.